据WHO的立场文件，双价HPV和四价HPV疫苗均可用于预防HPV-16型和HPV-18型引发的癌前病变和癌症；同时可能对少数非疫苗型别的高危HPV也有交叉保护作用。四价HPV疫苗还可用于预防HPV-6、HPV-11引发的肛门和生殖器疣。

国家药品监督管理总局批准的双价和四价HPV疫苗说明书规定：两种HPV疫苗均适用于预防高危型HPV16、18型所致下列疾病：宫颈癌；2级、3级宫颈上皮内瘤样病变（CIN2/3）和原位腺癌；1级宫颈上皮内瘤样病变（CIN1）。四价HPV疫苗的国内临床试验尚未证实其对低危HPV-6型和HPV-11型相关疾病的保护效果。