目前我国使用的脊灰疫苗主要有减毒活疫苗(OPV)和灭活疫苗(IPV)两种。

OPV不良反应低已为世界各国广泛使用的实践所证明，服苗后反应轻微，仅有个别小儿服后1-2天有低热、恶心、呕吐、皮疹或轻度腹泻，2-3天后不治自愈。一般不需医疗处理，必要时可对症治疗。如果腹泻较严重，可用止泻药治疗，多不需要用抗生素或磺胺药。极个别服苗后发生过敏反应的病例，一般也难以确定与OPV有关，而是与疫苗中的辅型剂（牛奶、奶油）有关，可根据情况对症治疗。接种脊灰疫苗引起的异常反应极为罕见。但是OPV在服苗者或其接触者中，极少数人由于免疫力低下等原因可能会发生的疫苗相关脊髓灰质炎麻痹（VAPP），发生率约为1/240万剂（WHO统计数据）。

IPV常见的不良反应有：注射部位局部反应，疼痛、红斑（皮肤发红）、硬结；中度、一过性的发热。非常罕见的不良反应有：注射部位局部肿胀和淋巴结肿大；荨麻疹、血管性水肿、过敏性休克等过敏反应；可能出现中度、一过性关节痛和肌痛；可能出现惊厥（伴或不伴发热），接种后两周内可能出现头痛、中度和一过性的感觉异常（主要位于下肢）；接种后最初几个小时或几天可能出现兴奋、嗜睡和易激惹，但很快会自然消失；广泛分布的皮疹；极早早产儿（胎龄不超过28周）可能出现呼吸暂停。